В gnome-terminal для вставки/копирования используются старые, добрые сочетания клавиш: Shift-Insert и Ctrl-Insert. Это не всегда удобно, когда приходится одновременно работать с гуёвыми приложениями работающих на Ctrl-C/Ctrl-V. Настроить сочетания клавиш gnome-terminal можно используя команду:

gconftool-2 -s /apps/gnome-terminal/keybindings/copy -t str "<Control>c"
gconftool-2 -s /apps/gnome-terminal/keybindings/paste -t str "<Control>v"

Здесь надо быть осторожным, так как комбинация Ctrl-C уже используется терминалом для остановки процессов.