Не секрет, что включенный компиз плохо сказывается на быстродействии opengl-приложений, а попросу говоря игр :-) (да, и еще хуже если это windows-игры :-) ). Чтобы не мучиться каждый раз отключая compiz вручную, можно написать для этого простейший скрипт:

1
2

#!/bin/bash
metacity --replace & $@; compiz-manager

Теперь, не забыв дать скрипту права на исполнение, можно с помощью него запускать любимое приложение, используя путь к программе в качестве параметра.

Поясню: команда metacity --replace заменяет все другие менеджеры окон на metacity; символ & означает что предыдущая команда будет исполнятся в фоне; символы $@ запускают наше opengl-приложение, ибо содержат параметр запуска скрипта; ну и последняя команда запускает compiz обратно в качестве менеджера окон.